Die Bundesgeschäftsstelle der Johanniter-Unfall-Hilfe in Österreich ist der Sitz des Vereinsvorstandes. Sie zeichnet für die bundesweite Abstimmung und Koordination verantwortlich, zu den Hauptaufgaben zählen:

• Strategieentwicklung
• Zusammenarbeit mit der Bundesregierung und den Bundesministerien
• Fachberatung
• Entwicklung neuer Dienstleistungen
• Personalentwicklung
• Tarifpolitik
• Kommunikation und Marketing
• Herausgeber von Publikationen
• Entwicklung von Jugend und Ehrenamt
• Zusammenarbeit mit Johanniter-International
• Zusammenarbeit mit der Diakonie Österreich